Tre skjebner flettes sammen i Kart over en usynlig verden. Tre mennesker merket av historien, både deres egen historie og Indonesias.

Tre ganger har Adam mistet alt. Han og broren Johan ble forlatt av moren da de var små, og på barnehjemmet der de ble plassert må han forsone seg med at Johan blir adoptert bort mens han selv blir alene tilbake. Som sekstenåring mister han på nytt alt som er trygt. Fra et skjulested blir han vitne til at Karl, nederlenderen som har oppdratt Adam som sin egen sønn, blir arrestert for å sendes ut av landet. Sukarno har begynt en nådeløs utrensking av utlendinger.

Det er på 60-tallet og Indonesia skal fri seg helt fra sin fortid som koloni. En håndfull gamle brev og bilder er alt Adam har etter adoptivfaren, ved hjelp av dem forsøker han å finne ut hva som kan ha skjedd med Karl. Jakten fører ham til Jakarta. Og i den fargerike og farlige hovedstaden får Adam nye venner, unge idealister med en politisk overbevisning som fascinerer unggutten. Mange mennesker skal bli berørt av skjebnen til brødreparet somså brutalt ble skilt da de var små. Mens Adam alltid lengter etter sin høyt elskede og idoliserte storebror, har Johan aldri klart å fri seg fra skammen og sorgen over hvordan han sviktet lillebroren.

Kart over en unsynlig verden er en sterk skildring av et land i en politisk brytningstid og en håndfull mennesker som får sine liv formet av det.